Tại điểm 1, mục IV, phần B Thông tư số 98/2002/TT-BTC ngày 24/10/2002 của Bộ Tài chính hướng dẫn thực hiện việc miễn, giảm thuế cho các đối tượng được hưởng ưu đãi đầu tư theo Nghị định số 51/1999/NĐ-CP ngày 08/7/1999 của Chính phủ quy định: Đối với doanh nghiệp nhà nước khi chuyển thành công ty cổ phần theo quy định tại Nghị định số 64/2002/NĐ-CP, mà doanh nghiệp mới thành lập vẫn thực hiện sản xuất, kinh doanh trên diện tích đất mà doanh nghiệp nhà nước đã thuê của nhà nước trước đây thì không được miễn tiền thuê đất theo quy định tại Điều 18 Nghị định số 51/1999/NĐ-CP và hướng dẫn tại Thông tư này. Trường hợp khi thực hiện chuyển đổi hình thức sở hữu, doanh nghiệp mới thành lập có thuê thêm đất của nhà nước để mở rộng sản xuất, kinh doanh thì doanh nghiệp chỉ được miễn tiền thuê đất theo hướng dẫn tại Thông tư này cho phần diện tích mới thuê thêm để mở rộng sản xuất, kinh doanh.

Tại khoản 1 Điều 13 Chương III Nghị định số 142/2005/NĐ-CP ngày 14/11/2005 của Chính phủ quy định về thu tiền thuê đất, thuê mặt nước có quy định về nguyên tắc miễn, giảm tiền thuê đất, thuê mặt nước như sau: “Đất thuê, mặt nước thuê để thực hiện dự án đầu tư thuộc đối tượng được miễn, giảm tiền thuê đất, thuê mặt nước thì được thực hiện theo từng dự án đầu tư”.

Căn cứ các quy định về miễn tiền thuê đất khi chuyển doanh nghiệp nhà nước thành công ty cổ phần được xử lý như sau:

- Trường hợp doanh nghiệp nhà nước được cổ phần hóa trước ngày Nghị định số 142/2005/NĐ-CP (nêu trên) có hiệu lực thi hành thì chỉ được xét miễn tiền thuê đất đối với phần diện tích mà doanh nghiệp mới thuê thêm để mở rộng sản xuất, kinh doanh.

- Sau ngày Nghị định số 142/2005/NĐ-CP (nêu trên) có hiệu lực thi hành thì việc miễn, giảm tiền thuê đất được xét theo từng dự án đầu tư theo quy định tại Chương III Nghị định số 142/2005/NĐ-CP (nêu trên).